La Institución Educativa Naguata, sede Santuario existe desde el año 1957, el local fue construido en terrenos donados por el señor Florentino Jiménez (Q.E.P.D) y el señor Ormistas Muñoz.

Inicialmente la construcción constaba de: un salón con corredor, una pieza como dormitorio y una cocina con estufa de carbón, una letrina, un patio con jardín

(Relato de Lic. Espec. Edilma León)

El nombre de "SANTUARIO" en honor al santuario del señor de los Alabastros o de los Tunos ; imagen esculpida en una piedra  y venera por los habitantes de la región y peregrinos venidos de diferentes partes del país. 

En 1.957 inició con un solo educador. En 1.970 la secretaria de Educación nombró un segundo educador. En 1.981 se nombró otro educador.

Actualmente contamos con un educador, dos salones, sala de informática, sala de video, cocina y comedor, baños cancha múltiple y zona verde.